Многие случаи цистита вызываются кишечной палочкой - бактерией, которая обычно безвредна и помогает процессу пищеварения. Но иногда она попадает из анального отверстия в близлежащую уретру.

Цистит еще иногда называют «болезнью медового месяца». Это объясняется тем, что частое механическое воздействие может повредить чувствительную кожу вокруг входа во влагалище и уретру, что предрасполагает к ее инфицированию.